Setelah beberapa tahun berjalan, AMKT Ruhui Rahayu telah mengalami dua kali masa periode kepengurusan, yaitu masa periode tahun 2008/2009 yang dipimpin oleh Maryana Aulia (Balikpapan) dan masa periode 2009/2010 yang dipimpin oleh Festy Inkananda (Samarinda). Serta Gubernur Kalimantan Timur, Bpk. Awang Faroek selaku pelindung kepengurusan.
Berikut adalah susunan kepengurusan dalam masing masing periode.
Kepengurusan AMKT Ruhui Rahayu Yogyakarta
periode 2008/2009
Ketua
Sekretaris
Bendahara
I. Murniyati
II. Lesmi Fitriowati
Bidang Kerohanian
II. Ayu Nirmala Sari
Bidang Hubungan Masyarakat
Bidang Kebersihan dan Keindahan
Kepengurusan AMKT Ruhui Rahayu Yogyakarta
periode 2009/2010
Ketua
Festy Inkananda
Sekretaris
Bendahara
I. Indri Hergina
II. Yulita Halim
Bidang Kerohanian
Bidang Hubungan Masyarakat
Bidang Kebersihan dan Keindahan
II. Siti Jumiati
Bidang Seni dan Budaya
